流通企業(yè)統(tǒng)一納稅是一個(gè)老問題，重點(diǎn)反映在連鎖零售企業(yè)、物流配送企業(yè)、電子商務(wù)企業(yè)，這些企業(yè)都涉及到網(wǎng)點(diǎn)的跨區(qū)域所產(chǎn)生的統(tǒng)一納稅和分別納稅問題。
　　早在2008年新的《企業(yè)所得稅法》實(shí)施后，取消了對物流企業(yè)所得稅統(tǒng)一繳納的規(guī)定，由此產(chǎn)生了割裂物流企業(yè)的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系，這不利于在企業(yè)內(nèi)部統(tǒng)籌盈虧，增加了集團(tuán)型企業(yè)運(yùn)營成本和稅負(fù)。也就是說，這一問題產(chǎn)生有6年時(shí)間了，但至今仍然未得到有效解決。
　　2003年，財(cái)政部與國家稅務(wù)總局聯(lián)合發(fā)出通知，對從事跨區(qū)域連鎖經(jīng)營的內(nèi)外資企業(yè)，統(tǒng)一由總部機(jī)構(gòu)在當(dāng)?shù)囟悇?wù)部門繳納企業(yè)所得稅，從而減輕企業(yè)負(fù)擔(dān)。但是文件出臺后，在許多地方并未得到落實(shí)。2013年物流業(yè)全面納入"營改增"后，集團(tuán)型企業(yè)又面臨不能合并繳納增值稅的問題。正所謂"老的問題沒有解決，又出現(xiàn)了新的問題"。
　　多頭納稅帶來的成本（增加），使一個(gè)企業(yè)內(nèi)部的資金不能有效地進(jìn)行統(tǒng)一運(yùn)作和管理，使企業(yè)的稅收和企業(yè)的利益不能在一個(gè)整體的范圍內(nèi)進(jìn)行調(diào)整和整體的反映。隨著我國的連鎖企業(yè)、物流配送、電子商務(wù)（特別是網(wǎng)店）迅速發(fā)展，納稅地點(diǎn)無法統(tǒng)一，已經(jīng)成為新興企業(yè)和新型業(yè)態(tài)跨區(qū)域發(fā)展的主要障礙之一。
　　跨區(qū)統(tǒng)一納稅之所以難以實(shí)現(xiàn)，其實(shí)質(zhì)是因?yàn)橐恍?quot;籬笆"存在。以連鎖企業(yè)為例，對于連鎖企業(yè)而言，由總部匯總納稅能使各門店的盈虧互相沖抵，從而減輕整體稅負(fù)，但對地方政府而言，將出現(xiàn)營業(yè)發(fā)生地與納稅地之間的脫節(jié)，即使規(guī)定了由總部所在地將稅收予以返還，也是盈虧相抵后的利潤按應(yīng)得比例返還，肯定比直接在當(dāng)?shù)厥斩愐�少。所以地方政府從心理上并不愿意接受這樣的政策，因?yàn)橛煽偛亢喜⒓{稅意味著連鎖店所在的地方稅收和財(cái)政收入將被砍掉一塊。
　　連鎖經(jīng)營反映出來的問題，在物流配送、電子商務(wù)（網(wǎng)店）上也反映出來，特別是集團(tuán)型物流企業(yè)在各地?fù)碛写罅康慕?jīng)營網(wǎng)點(diǎn)，有的擁有數(shù)千個(gè)經(jīng)營網(wǎng)點(diǎn)。這些經(jīng)
　　營網(wǎng)點(diǎn)統(tǒng)一品牌、統(tǒng)一服務(wù)，由總部統(tǒng)一管理、統(tǒng)
　　一經(jīng)營，亟待打破地區(qū)封鎖，實(shí)施跨區(qū)域統(tǒng)一納
　　稅。
　　對于不同的企業(yè)也需要具體情況具體分析，還要認(rèn)真研究2012年財(cái)政部出臺的《跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法》文件，研究和完善匯總納稅企業(yè)實(shí)行"統(tǒng)一計(jì)算、分級管理、就地預(yù)繳、匯總清算、財(cái)政調(diào)庫"的企業(yè)所得稅征收管理辦法，探索"營改增"出現(xiàn)的一些新情況。